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PET技术的优势在于其图像的精确性,但是该技术的可靠性在很大程度上取决于同位素的半衰期,因此时间效度较差,不适用于单个受试者的重复研究。同一受试者不宜频繁参加实验,不利于那些需要受试者多次参加实验的研究。另外,系统造价很高,除PET设备外,一般还需配备一台加速器,用以制备同位素。